组分 | 50 RXN (20 μL/RXN) | 250 RXN (20 μL/RXN) |
Entrans 2X qPCR Probe Master Mix V2 | 500 μL | 1.25mL X 2 |
50X ROX Dye I | 20μL | 100μL |
50X ROX Dye II | 20μL | 100μL |
Q1:扩增曲线形状异常
a.扩增曲线不光滑:信号太弱,提高模板浓度并重复实验。
b.个别扩增曲线骤降:反应管内有气泡,由于温度升高后气泡破裂,使仪器检测到的荧光信号突然降低所致。处理样本时要注意离心、加样过程中尽量避免出现气泡。
扩增曲线上飘:仪器默认基线为3-15个循环的荧光值,可根据实际扩增情况调整基线。另外模板或引物降解也可导致曲线上飘 (必要时请进行电泳确认)。
Q2:反应结束无扩增曲线
a.反应循环数不够:一般设置循环数为40,但需注意的是过多的循环会增加背景信号,降低数据可信度。
b.确认引物是否降解:长时间未用的引物应先通过PAGE电泳检测完整性,以排除引物降解的可能性。
c.确认程序中是否设置了信号采集步骤:两步法扩增程序一般将信号采集设置在退火延伸阶段;三步法扩增程序应当将信号采集设置在72℃延伸阶段。
d.模板浓度太低:减少稀释倍数并重复实验。
e.模板降解:重新制备模板,重复实验。
预变性时间不足:本产品采用化学修饰热启动的Taq DNA聚合酶,建议延长预变性时间,可以将预变性时间延长为10 min。
Q3:Ct值出现太晚
a.扩增效率极低:优化反应条件,重新设计引物。
b.模板浓度太低:减少稀释倍数,重复实验。
c.模板降解:重新制备模板,重复实验。
d.PCR产物太长:一般设计扩增子长度为70 -200 bp。
反应体系中含有PCR抑制剂:一般由模板引入,加大模板稀释倍数或者重新制备模板。
Q4:阴性对照也出现明显扩增
反应体系或者水被污染:更换新的Mix或水重复实验。反应体系在超净工作台内配制,减少气溶胶污染。
Q5:重复性差
a.加样体积失准:使用校准的移液器,增大微量试剂体积。
b.定量PCR仪器孔间温度不一致:定期校准仪器。
c.模板浓度太低:减少模板稀释倍数或提高加样体积。
d.阈值设置:对于不同板间的重复实验,请确保两次阈值设置一致。