选择合适的流式抗体，是确保流式实验成功的关键因素之一，选择流式抗体时，需注意以下关键点：
- 确定目的蛋白在待检细胞样本中的表达位置（胞膜表达、胞浆表达、胞核表达），同时注意候选抗体开发时所选取的抗原区域（见抗体说明书或咨询厂家），以确保抗体能够特异性识别到目的蛋白；
- 确定实验样本的种属；
- 确定抗体说明书是否已标注待检测的物种及流式应用；
- 尽量选择厂家做过滴度测试的直标抗体进行实验，减少实验步骤及流程。
随着流式细胞仪的不断发展及荧光染料的多样化，为进行多色流式提供了更多可能性，其优势包括同时检测单细胞上的多个标记物、收集丰富的细胞实验数据以及更加精确鉴别细胞群。同时，所需样本体积少、样本检测通量高，使流式细胞实验的效率明显提升，但检测更多抗原和荧光染料使多色流式配色更加复杂，在设计流式配色方案时，需重点关注如下要素：
- 仪器配置：在流式配色之前，务必了解您的仪器配置（激光器，滤光片）；
- 染料亮度：不同染料之间荧光亮度不同，可通过染色指数进行对比，染色指数越高，亮度越高；
- 抗原表达与染料搭配：弱表达抗原搭配较亮荧光染料，强表达抗原可搭配较弱荧光染料；
- 光谱重叠尽量小：不同通道荧光染料搭配时，选择发射光谱重叠尽量小的染料；
- 荧光干扰：荧光互相干扰的荧光染料用来标记不同细胞，然后对其分别设门分析；
- 细胞活性检测染料：流式多色方案中应包含细胞活性检测染料，排除死细胞和细胞碎片。
