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蛋白亲水性分析工具的算法来自于文献 Kyte and Doolittle; 1982 。该工具会根据统计数据为每一个氨基酸分配一个亲水值，整个序列的亲水值=所有氨基酸的亲水值除以总氨基酸数。

DNA分子量计算器用于计算一条至多条DNA序列的分子量。序列可以按照单链、双链、线性、环形方式进行计算。单链序列按具有5'磷酸化进行计算。

蛋白等电点计算器可以计算出蛋白序列的理论等电点。在跑二维凝胶电泳时，使用此工具可以预估蛋白的条带位置。

逆翻译工具可以根据密码子使用频率表将蛋白序列逆翻译为可编码的基因序列。来源于所有可能密码子的共有序列会被输出。需要为蛋白质设计编码DNA的引物时，可以使用此工具。

DNA翻译工具按照指定的阅读框位置将DNA翻译成蛋白。此工具支持所有的IUPAC字符和多种密码子表。

限制性酶切位点统计工具可以统计常用限制性酶切位点的数量和位置。使用此工具可以快速判断某限制性内切酶是否会切割目标DNA。