为了得到功能性的重组蛋白，使重组蛋白有正确的翻译后修饰，比如二硫键、糖基化及磷酸化等，通常需要使用哺乳动物细胞表达系统、杆状病毒-昆虫细胞表达系统、稳定细胞株构建平台以及大规模发酵平台来进行蛋白表达。为了开发功能性的抗体，比如中和/阻断等抗体，满足特定应用抗体，使用真核重组蛋白表达系统是成功的关键。选择重组蛋白表达系统时，要考虑重组蛋白的功能性、溶解度、产量等。利用真核蛋白表达系统，加快了对基因功能及药物研究的进程。
| 真核表达平台 | 优点 | 表达方式 | 应用 |
|---|---|---|---|
| 哺乳动物细胞表达系统 | 能诱导高效表达；对表达的重组蛋白进行正确折叠；重组蛋白有复杂糖基化等修饰；重组蛋白活性及构象接近于天然蛋白 | 瞬时转染稳定细胞株构建及大规模发酵 | 基因工程药物的生产平台，适用于蛋白组结构和功能研究。适用于表达分泌蛋白、酶类、离子通道蛋白等 |
| 杆状病毒- 昆虫细胞表达系统 | 可实现蛋白翻译后的加工修饰，如糖基化和磷酸化修饰等；蛋白表达量高，最高表达量可达昆虫细胞蛋白总量的50%；表达大片段的外源基因，最大可达到200KD | 杆状病毒- 昆虫细胞表达 | 基础研究及医药的生产平台，可大规模悬浮培养。适用于表达高等真核生物蛋白、分泌蛋白、蛋白复合物等 |
